课题组长
姓名：
白云助理教授 研究员 博士生导师, PhD, 助理教授
职务：
所在院所：
87978797威尼斯老品牌
荣誉称号：
教育经历：
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1999/09—2003/07，北京大学，学士
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2003/09—2010/02，美国哥伦比亚大学，博士
博士后及工作经历：
- 2010/04—2015/02，美国加州大学伯克利分校，博士后
- 2015/02—2015/12，美国加州大学伯克利分校，项目助理科学家
- 2016/01—至今，87978797威尼斯老品牌，87978797威尼斯老品牌，助理教授（TENURE-TRACK）
课题组简介
研究内容：
RNA不仅是遗传信息的载体，同时在生命过程中发挥重要的调控功能，它的失调与多种疾病（如癌症、神经退行性疾病等）密切相关。白云课题组结合系统生物学、细胞生物学、分子生物学和结构生物学等方法，揭示RNA如何通过形成特定结构、或者选择性的与蛋白质结合/聚集等不同机制参与真核细胞的代谢调控。
研究成果展示
（1）RNA病毒及其与宿主的相互作用： 运用系统生物学的方法揭示了特异的病毒RNA结合蛋白对宿主转录组的系统调控作用。并运用细胞生物学、分子生物学等方法进一步阐明了宿主免疫反应相关的mRNA受到该病毒蛋白调节的具体分子机理。 利用分子生物学和生物化学的方法在体外重构相关RNA与RNA结合蛋白复合体，揭示其相互作用的特定模式及其发挥功能的具体机制。 （2）细胞应激反应及mRNA命运决定： 揭示细胞应激颗粒形成与解聚过程中的动态变化。 探索在细胞不同应激阶段mRNA命运决定的具体机制。 （3）RNA结构元件的发现和功能探索
代表性论文（*第一作者，#通讯作者）
- 1.Jiang, Weijun*; Shi, Jiajia; Zhao, Jingjie; Wang, Qiu; Cong, Dan; Chen, Fenghua; Zhang, Yu; Liu, Yuhan; Zhao, Junzheng; Chen, Qian; Gu, Linhao; Zhou, Wenjia; Wang, Chenhang; Fang, Zhaoyuan; Geng, Shuhui; Xie, Wei; Chen, Luo-Nan; Yang, Yang; Bai, Yun#; Lin, Haodong#; Li, Xiajun#.ZFP57 dictates allelic expression switch of target imprinted genes.PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. Feb 2021. 118(5):e2005377118.
- 2.Li, Xiajun#*; Li, Max Jiahua; Yang, Yang; Bai, Yun.Effects of reprogramming on genomic imprinting and the application of pluripotent stem cells.STEM CELL RESEARCH. Dec 2019. 41.
- 3.Carlson, Lars-Anders#*; Bai, Yun; Keane, Sarah C; Doudna, Jennifer A; Hurley, James H#.Reconstitution of selective HIV-1 RNA packaging in vitro by membrane-bound Gag assemblies.ELIFE. 25 Jun 2016.
- 4.Bai, Yun*; Tambe, Akshay; Zhou, Kaihong; Doudna, Jennifer A.#.RNA-guided assembly of Rev-RRE nuclear export complexes.ELIFE. 2014. 3.
- 5.Bai, Yun*; Zhou, Kaihong; Doudna, Jennifer A.#.Hepatitis C virus 3 ' UTR regulates viral translation through direct interactions with the host translation machinery.NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2013. 41(16):7861-7874.
- 6.Berry, Katherine E.*; Waghray, Shruti; Mortimer, Stefanie A.; Bai, Yun; Doudna, Jennifer A.#.Crystal Structure of the HCV IRES Central Domain Reveals Strategy for Start-Codon Positioning.STRUCTURE. 2011. 19(10):1456-1466.
- 7.Sun, Chaomin*; Todorovic, Aleksandar; Querol-Audi, Jordi; Bai, Yun; Villa, Nancy; Snyder, Monica; Ashchyan, John; Lewis, Christopher S.; Hartland, Abbey; Gradia, Scott; Fraser, Christopher S.; Doudna, Jennifer A.#; Nogales, Eva; Cate, Jamie H. D.#.Functional reconstitution of human eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3).PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 2011. 108(51):20473-20478.
- 8.Bai, Yun*; Srivastava, Sandeep K.; Chang, Jeong Ho; Manley, James L.; Tong, Liang#.Structural Basis for Dimerization and Activity of Human PAPD1, a Noncanonical Poly(A) Polymerase.MOLECULAR CELL. 2011. 41(3):311-320.
- 9.Mandel, C. R.*; Bai, Y.; Tong, L.#.Protein factors in pre-mRNA 3'-end processing.CELLULAR AND MOLECULAR LIFE SCIENCES. 2008. 65(2020-07-08):1099-1122.
- 10.Bai, Yun*; Auperin, Thierry C.; Chou, Chi-Yuan; Chang, Gu-Gang; Manley, James L.; Tong, Liang#.Crystal structure of murine CsfF-77: Dimeric Association and implications for polyadenylation of mRNA precursors.MOLECULAR CELL. 2007. 25(6):863-875.
- 11.Bai, Yun*; Auperin, Thierry C.; Tong, Liang#.The use of in situ proteolysis in the crystallization of murine CstF-77.ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS. 2007. 63:135-138.
- 12.Rudolph, MJ*; Amodeo, GA; Bai, Y; Tong, L#.Crystal structure of the protein kinase domain of yeast AMP-activated protein kinase Snf1.BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS. 2005. 337(4):1224-1228.
课题组成员及合影
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姓名：何靓
身份：工程师
在组时间：2018/01-至今
邮箱：heliang@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：马琳莎
身份：博士研究生
在组时间：2017/03-至今
邮箱：malsh@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：吴浩
身份：博士研究生
在组时间：2017/03-至今
邮箱：wuhao1@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：胡书耀
身份：博士研究生
在组时间：2018/03-至今
邮箱：hushy@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：王梦婷
身份：博士研究生
在组时间：2018/03-至今
邮箱：wangmt1@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：易倩倩
身份：博士研究生
在组时间：2019/03-至今
邮箱：yiqq@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：陈博文
身份：硕士研究生
在组时间：2019/03-至今
邮箱：chenbw@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：周彩妮
身份：硕士研究生
在组时间：2020/03-至今
邮箱：zhoucn@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：张雨凤
身份：硕士研究生
在组时间：2020/03-至今
邮箱：zhangyf4@@shanghaitech.edu.cn
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