课题组长
姓名：
徐菲副教授 研究员 博士生导师, PhD, 副教授
职务：
所在院所：
87978797威尼斯老品牌、iHuman研究所
荣誉称号：
教育经历：
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2002/09—2006/07，中国科学技术大学，学士
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2006/07—2011/06，美国斯克里普斯研究所，博士
博士后及工作经历：
- 2011/08—2013/09，美国锐意生物医药有限公司，研发顾问
- 2013/09—2014/08，87978797威尼斯老品牌，iHuman研究所，副研究员
- 2014/08—2019/12，87978797威尼斯老品牌，87978797威尼斯老品牌、iHuman研究所，助理教授（TENURE-TRACK）
- 2019/12—至今，87978797威尼斯老品牌，87978797威尼斯老品牌、iHuman研究所，副教授（TENURED）
课题组简介
研究内容：
课题组使用世界领先的膜蛋白结构生物学和细胞生物学结合的方法，研究与人类胚胎发育及癌症发生密切 相关的一类信号转导受体-GPCR 靶点，包括其分子结构，信号转导复合物结构与功能，以及药物小分子 与抗体筛选等。
研究成果展示
课题组使用最前沿的GPCR 相关技术解决重要的生物学问题及发展药物开发与应用。报道了首个人源孤儿受体GPR52不同功能状态的三维结构，提出了具有高本底活性的孤儿受体特有的自激活机制，论文发表在2020年2月的《Nature》上；卷曲受体家族首个蛋白结构的解析揭示了该家族蛋白的独特结构特征和作为潜在癌症靶点的研究潜力，论文发表在2018 年7 月的《Nature》上；癌症靶标平滑受体的全长结构研究揭示了新的药物作用靶点与机制，论文发表在2017 年5 月的《Nature Communications》上；和国际知名制药公司合作，解析了心血管疾病靶标人源apelin 受体结合类天然多肽配体的高分辨率结构，论文发表在2017 年6 月的《Cell》子刊《Structure》上。
代表性论文（*第一作者，#通讯作者）
- 1.Yue, Yang*; Liu, Lier; Wu, Li-Jie; Wu, Yiran; Wang, Ling; Li, Fei; Liu, Junlin; Han, Gye-Won; Chen, Bo; Lin, Xi; Brouillette, Rebecca L.; Breault, Emile; Longpre, Jean-Michel; Shi, Songting; Lei, Hui; Sarret, Philippe; Stevens, Raymond C.; Hanson, Michael A.; Xu, Fei#.Structural insight into apelin receptor-G protein stoichiometry.NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY. Jul 2022. 29(7).
- 2.Lin Xi*, Chen B, Wu Y*, Han Y, Qi A, Wang J, Yang Z, Wei X, Zhao T, Wu L, Xie X, Sun J, Zheng J#, Zhao S#, Xu F#.Cryo-EM structures of orphan GPR21 signaling complexes.Nature Communications. Jan 2023.
- 3.Zheng, You*; Liu, Heng; Chen, Yuxin; Dong, Shaowei; Wang, Fang; Wang, Shengyi; Li, Geng-Lin; Shu, Yilai#; Xu, Fei#.Structural insights into the lipid and ligand regulation of a human neuronal KCNQ channel.NEURON. 19 Jan 2022. 110(2).
- 4.Xu, Lu*; Chen, Bo; Schihada, Hannes; Wright, Shane C.; Turku, Ainoleena; Wu, Yiran; Han, Gye-Won; Kowalski-Jahn, Maria; Kozielewicz, Pawel; Bowin, Carl-Fredrik; Zhang, Xianjun; Li, Chao; Bouvier, Michel; Schulte, Gunnar#; Xu, Fei#.Cryo-EM structure of constitutively active human Frizzled 7 in complex with heterotrimeric G(s).CELL RESEARCH. Dec 2021.
- 5.Chen Yuxiang*, Chen B*, Wu T*, Zhou F, Xu F#.Cryo-EM structure of human κ-opioid receptor-Gi complex bound to an endogenous agonist dynorphin A.Protein & Cell. Aug 2022.
- 6.Lin, Xi*; Li, Mingyue*; Wang, Niandong*; Wu, Yiran*; Luo, Zhipu; Guo, Shimeng; Han, Gye-Won; Li, Shaobai; Yue, Yang; Wei, Xiaohu; Xie, Xin; Chen, Yong; Zhao, Suwen; Wu, Jian#; Lei, Ming#; Xu, Fei#.Structural basis of ligand recognition and self-activation of orphan GPR52.NATURE. 19 Feb 2020.
- 7.Yang, Shifan*; Wu, Yiran; Xu, Ting-Hai; de Waal, Parker W.; He, Yuanzheng; Pu, Mengchen; Chen, Yuxiang; DeBruine, Zachary J.; Zhang, Bingjie; Zaidi, Saheem A.; Popov, Petr; Guo, Yu; Han, Gye Won; Lu, Yang; Suino-Powell, Kelly; Dong, Shaowei; Harikumar, Kaleeckal G.; Miller, Laurence J.; Katritch, Vsevolod; Xu, H. Eric; Shui, Wenqing; Stevens, Raymond C.; Melcher, Karsten; Zhao, Suwen; Xu, Fei#.Crystal structure of the Frizzled 4 receptor in a ligand-free state.NATURE. 2018. 560(7720):666-670.
- 8.Zhang, Xianjun*; Zhao, Fei; Wu, Yiran; Yang, Jun; Han, Gye Won; Zhao, Suwen; Ishchenko, Andrii; Ye, Lintao; Lin, Xi; Ding, Kang; Dharmarajan, Venkatasubramanian; Griffin, Patrick R.; Gati, Cornelius; Nelson, Garrett; Hunter, Mark S.; Hanson, Michael A.; Cherezov, Vadim; Stevens, Raymond C.; Tan, Wenfu#; Tao, Houchao#; Xu, Fei#.Crystal structure of a multi-domain human smoothened receptor in complex with a super stabilizing ligand.NATURE COMMUNICATIONS. 17 May 2017. 8(1).
- 9.Zhang, Xianjun*; Dong, Shaowei; Xu, Fei#.Structural and Druggability Landscape of Frizzled G Protein-Coupled Receptors.TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES. Dec 2018. 43(12):1033-1046.
- 10.Xu, Fei*; Wu, Huixian; Katritch, Vsevolod; Han, Gye Won; Jacobson, Kenneth A.; Gao, Zhan-Guo; Cherezov, Vadim; Stevens, Raymond C.#.Structure of an Agonist-Bound Human A(2A) Adenosine Receptor.SCIENCE. 2011. 332(6027):322-327.
- 11.Zhang, Xianjun*; Stevens, Raymond C.; Xu, Fei#.The importance of ligands for G protein-coupled receptor stability.TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES. Feb 2015. 40(2):79-87.
- 12.Ma, Yingli*; Yue, Yang; Ma, Yanbin; Zhang, Qing; Zhou, Qingtong; Song, Yunpeng; Shen, Yuqing; Li, Xun; Ma, Xiaochuan; Li, Chao; Hanson, Michael A.; Han, Gye Won; Sickmier, E. Allen; Swaminath, Gayathri; Zhao, Suwen; Stevens, Raymond C.; Hu, Liaoyuan A.; Zhong, Wenge; Zhang, Mingqiang; Xu, Fei#.Structural Basis for Apelin Control of the Human Apelin Receptor.STRUCTURE. 06 Jun 2017. 25(6):858-+.
- 13.Xu, Fei*; Liu, Wei; Hanson, Michael A.; Stevens, Raymond C.; Cherezov, Vadim#.Development of an Automated High Throughput LCP-FRAP Assay to Guide Membrane Protein Crystallization in Lipid Mesophases.CRYSTAL GROWTH & DESIGN. 2011. 11(4):1193-1201.
- 14.Xu, Fei*; Stevens, Raymond C.#.Trapping Small Caffeine in a Large GPCR Pocket.STRUCTURE. 2011. 19(9):1204-1207.
- 15.Liu, Wei*; Chun, Eugene; Thompson, Aaron A.; Chubukov, Pavel; Xu, Fei; Katritch, Vsevolod; Han, Gye Won; Roth, Christopher B.; Heitman, Laura H.; IJzerman, Adriaan P.; Cherezov, Vadim#; Stevens, Raymond C.#.Structural Basis for Allosteric Regulation of GPCRs by Sodium Ions.SCIENCE. 2012. 337(6091):232-236.
- 16.Chun, Eugene*; Thompson, Aaron A.; Liu, Wei; Roth, Christopher B.; Griffith, Mark T.; Katritch, Vsevolod; Kunken, Joshua; Xu, Fei; Cherezov, Vadim; Hanson, Michael A.#; Stevens, Raymond C.#.Fusion Partner Toolchest for the Stabilization and Crystallization of G Protein-Coupled Receptors.STRUCTURE. 2012. 20(6):967-976.
- 17.Tosh, Dilip K.*; Phan, Khai; Gao, Zhan-Guo; Gakh, Andrei A.; Xu, Fei; Deflorian, Francesca; Abagyan, Ruben; Stevens, Raymond C.; Jacobson, Kenneth A.#; Katritch, Vsevolod#.Optimization of Adenosine 5 '-Carboxamide Derivatives as Adenosine Receptor Agonists Using Structure-Based Ligand Design and Fragment Screening.JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. 2012. 55(9):4297-4308.
- 18.Deflorian, Francesca*; Kumar, T. Santhosh; Phan, Khai; Gao, Zhan-Guo; Xu, Fei; Wu, Huixian; Katritch, Vsevolod; Stevens, Raymond C.; Jacobson, Kenneth A.#.Evaluation of Molecular Modeling of Agonist Binding in Light of the Crystallographic Structure of an Agonist-Bound A(2A) Adenosine Receptor.JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. 2012. 55(1):538-552.
- 19.Xue, Dongxiang*; Ye, Lintao; Zheng, Jun; Wu, Yiran; Zhang, Xianjun; Xu, Yueming; Li, Tao; Stevens, Raymond C.; Xu, Fei; Zhuang, Min; Zhao, Suwen; Zhao, Fei#; Tao, Houchao#.The structure-based traceless specific fluorescence labeling of the smoothened receptor.ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY. 07 Jul 2019. 17(25):6136-6142.
- 20.Ye, Lintao*; Ding, Kang; Zhao, Fei; Liu, Xiaoyan; Wu, Yiran; Liu, Yang; Xue, Dongxiang; Zhou, Fang; Zhang, Xianjun; Stevens, Raymond C.; Xu, Fei; Zhao, Suwen#; Tao, Houchao#.A structurally guided dissection-then-evolution strategy for ligand optimization of smoothened receptor.MEDCHEMCOMM. Jun 2017. 8(6):1332-1336.
- 21.Zhao, Huan*; Tian, Xueying; He, Lingjuan; Li, Yan; Pu, Wenjuan; Liu, Qiaozhen; Tang, Juan; Wu, Jiaying; Cheng, Xin; Liu, Yang; Zhou, Qingtong; Tan, Zhen; Bai, Fan; Xu, Fei; Smart, Nicola; Zhou, Bin#.Apj(+) Vessels Drive Tumor Growth and Represent a Tractable Therapeutic Target.CELL REPORTS. 30 Oct 2018. 25(5):1241-+.
- 22.Zhou, F.*; Ding, K.; Zhou, Y.; Liu, Y.; Liu, X.; Zhao, F.; Wu, Y.; Zhang, X.; Xu, F.; Zhao, S.; Tao, H..Determination of an underneath binding in the transmembrane domain of smoothened receptor.JOURNAL OF BIOENERGETICS AND BIOMEMBRANES. Dec 2018. 50(6):510-510.
- 23.Lin, X.*; Xu, F..Toward the first orphan GPCR structure.JOURNAL OF BIOENERGETICS AND BIOMEMBRANES. Dec 2018. 50(6):559-559.
- 24.Zhou, Fang*; Ding, Kang; Zhou, Yiqing; Liu, Yang; Liu, Xiaoyan; Zhao, Fei; Wu, Yiran; Zhang, Xianjun; Tan, Qiwen; Xu, Fei; Tan, Wenfu; Xiao, Youli#; Zhao, Suwen#; Tao, Houchao#.Colocalization Strategy Unveils an Underside Binding Site in the Transmembrane Domain of Smoothened Receptor.JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. 14 Nov 2019. 62(21):9983-9989.
奖励
- 1.2014年，上海市浦江人才
- 2.2018年，中科院分子细胞卓越中心青年骨干（徐菲）
- 3.2019年，上海市优秀学术带头人（徐菲）
- 4.2020年，药明康德生命化学研究奖（徐菲）
- 5.2020年，博士后创新人才支持计划（林浠）
课题组成员及合影
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姓名：岳洋
身份：高级工程师
在组时间：2014/07-至今
邮箱：yueyang@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：林浠
身份：博士后
在组时间：2020/8-至今
邮箱：linxi@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：徐鹭
身份：博士后
在组时间：2022/1-至今
邮箱：xulu@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：刘立尔
身份：博士研究生
在组时间：2017/01-至今
邮箱：liule@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：郑优
身份：博士研究生
在组时间：2019/03-至今
邮箱：zhengyou@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：张智斌
身份：博士研究生
在组时间：2019/09-至今
邮箱：zhangzhb@shanghaitech.edu.cn
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姓名：姜可新
身份：博士研究生
在组时间：2019/09-至今
邮箱：jiangkx1@shanghaitech.edu.cn
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姓名：李翠霞
身份：博士研究生
在组时间：2019/09-至今
邮箱：licx@shanghaitech.edu.cn
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姓名：陈博
身份：助理研究员
在组时间：2020/8-至今
邮箱：chenbo@shanghaitech.edu.cn
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姓名：关晓宇
身份：硕士研究生
在组时间：2020/9-至今
邮箱：guanxy@shanghaitech.edu.cn
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姓名：蒋姗
身份：博士研究生
在组时间：2020/9-至今
邮箱：jiangshan1@shanghaitech.edu.cn
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姓名：张忠原
身份：硕士研究生
在组时间：2021/9-至今
邮箱：zhangzhy5@shanghaitech.edu.cn
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姓名：严鹏飞
身份：硕士研究生
在组时间：2021/9-至今
邮箱：yanpf@shanghaitech.edu.cn
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